肛肠医院医生说慢性腹泻的危害很大，急性腹泻在治疗期上较短。这种慢性腹泻的症状不是很突出，往往不容易引起人们的重视。结果一般是出现了其他更为严重的症状才能引起人们的关注。肛肠医院医生说长期的慢性腹泻可能会导致人体营养不良。
肛肠医院医生说慢性腹泻导致禁食时间过久或长期热量不足，各种维生素流失和缺乏引起营养不良。消化不良与营养不良可互为因果，往往造成恶性循环，导致不良后果。维生素A缺乏可引起干眼症及角膜软化症;维生素D缺乏可引起手足抽搐症。
感染是常见有中耳炎、口角炎、上呼吸道感染、支气管炎、肺炎、疖肿、败血症、泌尿道感染及静脉炎等。有慢性腹泻可以引起，各种感染可能成为腹泻的病因，但也有在腹泻之后，由于全身抵抗力降低而继发感染。迁延性腹泻或原有营养不良病儿，容易并发真菌感染，如鹅口疮、真菌性肠炎，甚至引起全身性真菌病。
肛肠医院医生说中毒性肝炎重型腹泻可能出现黄疸，常见于营养不良及重症败血症病儿，预后不良，故中毒性肝炎是慢性腹泻的严重并发症之一。
还有些其他疾病会出现，肛肠医院医生说慢性腹泻还能导致如急性肾功能衰竭、弥漫性血管内凝血、感染性休克、中毒性脑病等，如处理不当还可发生急性心力衰竭、高血钾、中毒性肠麻痹、肠出血、肠套叠等，偶可见肠穿孔和腹膜炎。
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